Ich würde auch auf eine allergie tippen...entweder Umwelt also wie Milben, Blüten, gräser usw oder irgendwas im Futter.
Ist zwar jetzt kein Notfall aber ich würde schon sagen das ihr euch am besten so schnell wie möglich einen termin geben lasst, denn das ist natürlich nicht schön und angenehm für euren Hund.
Das kopfschütteln könnte auf eine Entzündung in den Ohren hindeuten und ist oft auch ein Zeichen einer allergie bzw Unverträglichkeit.